Ответственный за рубрику – доктор геолого-минералогических наук Е.А. Рогозина
Статья № 16_2012 дата поступления в редакцию 21.11.2011 подписано в печать 13.03.2012
28 с.
pdf  К проблеме биологического окисления нефти и нефтепродуктов углеводородокисляющими микроорганизмами
Проведён анализ литературных данных на предмет биологического окисления различных классов углеводородов нефти и нефтепродуктов углеводородокисляющими микроорганизмами. Рассмотрены различные механизмы биоокисления углеводородов, а также биогенное окисление нефтей различных по химическому составу.

Ключевые слова: углеводороды, механизм окисления, углеводородокисляющие микроорганизмы, нефть, нефтепродукты.
ссылка на статью обязательна Тимергазина И.Ф., Переходова Л.С. К проблеме биологического окисления нефти и нефтепродуктов углеводородокисляющими микроорганизмами // Нефтегазовая геология. Теория и практика. – 2012. - Т.7. - №1. - http://www.ngtp.ru/rub/7/16_2012.pdf
Литература

   Бабаев Э.Р., Мовсумзаде М.Э. Преобразование нефти в процессе её микробиологической деградации в почве // Башкирский химический журнал, 2009. – Т.16. - №3. – С. 80-87.
   Бабошин М.А., Баскунов Б.П., Финкельштейн З.И., Головлев Е.Л., Головлева Л.А. Микробная трансформация фенантрена и антрацена // Микробиология, 2005. - №3. – С. 357-364.
   Готтшлак Г. Метаболизм бактерий. / Под редакцией Е.Н. Кондратьевой. Пер. с английского Г.П. Мирошниченко и Т.Ю. Переслени. – М.: Наука, 1976. – 322 с.
   Восстановление нефтезагрязнённых почвенных экосистем. Под редакцией М.А. Глазовской. – М.: Наука, 1988. – 253 с.
   Киреева Н.А., Григориади А.С., Хайбулина Е.Ф. Ассоциации углеводородокисляющих микроорганизмов для биоремедиации нефтезагрязнённых почв // Вестник Башкирского университета, 2009. – Т.14. - №2. – С. 391-394.
   Киреева Н.А., Водопьянов В.В., Григориади А.С., Новосёлова Е.И., Багаутдинова Г.Г., Гареева А.Р., Лобастова Е.Ю. Эффективность применения биопрепаратов для восстановления плодородия техногенно-загрязнённых почв // Известия Самарского научного центра Российской академии наук, 2010. – Т.12. - №1(4). – С. 1023-1026.
   Кодина Л.А. Геохимическая диагностика нефтяного загрязнения почвы // Восстановление нефтезагрязнённых почвенных экосистем. – М.: Наука, 1988. – С. 112-122.
   Кошелева И.А., Балашова Н.В., Измалкова Т.Ю., Филонов А.Е., Соколов С.Л., Слепенькин А.В., Боронин А.М. Деградация фенантрена мутантными штаммами – деструкторами нафталина // Микробиология, 2000. - №6. – С. 783-789.
   Ленёва Н.А., Коломыцева М.П., Баскунов Б.П., Головлёва Л.А. Деградация фенантрена и антрацена бактериями рода Rhodococcus // Прикладная биохимия и микробиология, 2009. - №2. – С. 188-194.
   Матенькова Е.А., Наплекова Н.Н. Состав микробных ассоциаций дерново-подзолистых почв с нефтяным загрязнением // Достижения науки и техники АПК, 2009. - №4. – С. 20-21.
   Петриков К.В., Якшина Т.В., Власова Е.П., Пунтус И.Ф., Нечаева И.А., Самойленко В.А., Филонов А.Е. Изучение выживаемости микроорганизмов-деструкторов нефти родов Pseudomonas и Rhodococcus при различных способах хранения. Материалы международной конференции «Современное состояние и перспективы развития микробиологии и биотехнологии», 2-6 июня 2008. - Минск, 2008. - С. 223-225.
   Преобразование нефтей микроорганизмами // Тр. ВНИГРИ. Под редакцией Б.Г. Хотимского и А.И. Акопиан. – Л.: ВНИГРИ, 1970. - 281с.
   Пунтус И.Ф., Филонов А.Е., Ахметов Л.И., Карпов А.В., Боронин А.М. Деградация фенантрена бактериями родов Pseudomonas и Burkholderia в модельных почвенных системах // Микробиология, 2008. - №1. – С. 11-20.
   Рогозина Е.А., Шиманский В.К. Некоторые теоретические аспекты восстановления нефтезагрязнённых почвенных экосистем // Нефтегазовая геология. Теория и практика. – 2007. - №4. – http://www.ngtp.ru/rub/7/012.pdf
   Рогозина Е.А., Андреева О.А., Жаркова С.И., Мартынова Д.А. Сравнительная характеристика отечественных биопрепаратов, предлагаемых для очистки почв и грунтов от загрязнений нефтью и нефтепродуктами // Нефтегазовая геология. Теория и практика. - 2010. – Т.5. - №4. – http://www.ngtp.ru/rub/7/37_2010.pdf
   Розанова Е.П., Кузнецов С.И. Микрофлора нефтяных месторождений. – М.: Наука, 1974. – 197 с.
   Скрябин Г.К., Головлёва Л.А. Использование микроорганизмов в органическом синтезе. – М.: Наука, 1976. – 332 с.
   Успехи микробиологии. / Под редакцией А.А. Имшеницкого. – М.: «Наука», 1968а. – Т. 5. – 165 с.
   Успехи микробиологии. / Под редакцией А.А. Имшеницкого. – М.: «Наука», 1968б. – Т. 15. – 225 с.
   Финкельштейн З.И., Баскунов Б.П., Головлев Е.Л., Вервурт Ж., Ритьенс И.М., Бабошин М.А., Головлева Л.А. Превращения флуорена бактериями рода Rhodococcus // Микробиология, 2003. - №6. – С. 746-751.
   Чахмахчёв В.А. Геохимия процесса миграции углеводородных систем. - М.: Недра, 1983. – 230 с.
   Bayley S.A., Morris D.W., Broda P. The relationship of degradaiive and resistance plasmids of Pseudomonas belonging to the same incompatibility group // Nature, 1979. - Vol. 280. - P. 338-339.
   Birnboim H.C., Doly J.A. A rapid alkaline extraction procedure for screening recombinant plasmid DNA // Nucleic Acids Research. - 1979. - Vol. 7. - P. 1513-1519.
   Boldrin В., Tiehm A.. Fritzsche C. Degradation phenanthrene, fluorene, fluoranthene and pyrene by Mycobacterium sp. // Applied and Environmental Microbiology. - 1993. - Vol. 59. - P. 1927-1930.
   Bruheim P., Eimhjellen K. Chemically emulsified crude oil as substrate for bacterial oxidation: differences in species response // Canadian Journal of Microbiology. - 1998. -Vol. 44(2). - P. 195– 204.
   Cerniglia СЕ. Biodegradation of polycyclic aromatic hydrocarbons //Biodegradation. - 1992. –Vol. 3. - P. 351-368.
   Chakrabarty A. M. Genetic basis of the biodegradation of salicylate in Pseudomonas // Journal of Bacteriology. - 1977. - Vol. 112. - P. 815-823.
   Churchill S.A., Harper J.P., Churchill P.F. Isolation and characterization of a Mycobacterium species capable of degrading three- and four-ring aromatic and aliphatic hydrocarbons // Applied and Environmental Microbiology. - 1999. -Vol. 65. - P. 549 – 552.
   Crawford R.L., Frick T.D. Purification and properties of gentisate-l,2-dioxygenase from Moraxella osloensis // Journal of Bacteriology. - 1975. - Vol. 121. - P. 794-799.
   Dua R.D., Meera S. Purification and characterisation of naphthalene oxygenase from Corynebacterium renale // European J Biochem. – 1981. - Vol. 120. - P. 461-465.
   Dunn N.W., Gunsalus I.C. Transmissible plasmid coding early enzymes of naphthalene oxidation in Pseudomonas putida // Journal of Bacteriology. - 1973. - Vol. 114. – P. 974-979.
   Evans W.C., Fcrnley HN., Griffits E. Oxidative metabolism of phenanthrene and anthracene by soil Pseudomonads // Biochemical Journal. - 1965. - Vol. 98. - P. 819-831.
   Feist C.F., Hegeman G.D. Phenol and benzoate metabolism by Pseudomonas putida of tangential pathways // Journal of Bacteriology. - 1969. - Vol. 100. - P. 869-877.
   Fuenniayor S.L.,Wild M.. Boyles A.L., Williams P.A. A gene cluster encoding steps in conversion of naphthalene to centisate in Pseudomonas sp. strain U2 // Journal of Bacteriology. - 1998. - Vol. 180. - P. 2522-2530.
   Gasellas M., Grifoll M., Sebate J., Solanas A.M. Isolation and characterization of a fluorenone-degrading bacterial strain and its role in synergistic degradation of fluorene by a consortium // Canadian Journal of Microbiology. - 1998. - Vol. 44. - P. - 734-742.
   Grifoll М., Gasellas М., Bayona J., Solanas A.M. Isolation and characterization of a fluorenedegrading bacterium: identification of ring oxidation and ring fission products // Applied and Environmental Microbiology. - 1992. – Vol. 58. - P. 2910-2917.
   Harayama S., Don R. H. Catabolic plasmids: their analysis and utilization in the manipulation of bacterial metabolic activities //Genetic engineering: principles and methods. - 1985. - Vol. 7. - P. 283-307.
   Herwijnen R., Sprigael D., Slot P., Govers H., Parsons J. Degradation of anthracene by Mycobacterium sp. strain LB 501T proceeds via a novel pathway, through o-phthalic acid// Applied and Environmental Microbiology. - 2003. - Vol. 69. - P. 186-190.
   Kalb V.F., Bernlohr R.W. A new spectrophotometric assay for protein in cell extract // Analytical Biochemistry. - 1977. - Vol. 82. – P. 362-366.
   Kastner M., Breuer-Jammali M., Mahro H. Enumeration and characterization of the soil microflora from hydrocarbon-contaminated soil sites able to mineralize polycyclic aromatic hydrocarbons (PAH) // Applied Microbiology and Biotechnology. - 1994. - Vol. 41. - P. 267-273.
   Kiyohara H., Nagao K., Nomi R. Degradation of phenanthrene through o-phthalic acid bv an Aeromonas sp. // Agricultural and biological chemistry. - 1976. - Vol.40. - P. 1075-1082.
   Kiyohara H., Nagao K. The catabolism of phenantrene and naphthalene by bacteria// Journal of General Microbiology. - 1978. - Vol. 105. - P. 69-75.
   Kiyohara H., Nagdd K., Yana K. Rapid screen for bacteria degrading water-insoluble, solid hydrocarbons on agar plates // Applied and Environmental Microbiology. - 1982. - Vol. 43. - P. 454 457.
   Moody J.D., Freeman J.P., Doerge D.R., Cerniglia C.E. Degradation of phenanthrene and anthracene by cell suspension of Mycobacterium sp. strain PYR-1 // Applied and Environmental Microbiology. – 2001. - Vol. - 67. - P. 1476-1483.
   Rueter P., Rabus R., Wilkest H., Aeckersberg F., Rainey Fred A., Holger W. Anaerobic oxidation of hydrocarbons in crude oil by new types of sulphate-reducing bacteria // Nature. - 1994. -Vol. 372. - P. 455 – 458.
   Samunta S.K., Chakrabarti A.K. Jain R.K. Degradation of phenanthrene by different bacteria: evidence for novel transformation sequences involving the formation of 1-naphthol // Applied Microbiology and Biotechnology. - 1999. - Vol. 53. - P. 98-107.
   Samanta S.K., Singh О.V. Polycyclic aromatic hydrocarbons: environmental pollution and bioremediation // Trends in Biotechnology. - 2002. - Vol. 20. - P. 243-248.
   Saemori A., Nakajima K., Kiirane R., Nakamura Y. Production of 3,4-dihydroxyphthalate from phthalate by a membrane-bound two enzyme system from Rhodococcus erythropolis // Applied Microbiology and Biotechnology. - 1995. - Vol. 43. - P. 470-472.
   Stringfellow W., Aitren M.D. Competitive metabolism of naphthalene, mefhylnaphthalenes and fluorene by phenanfhrene-degrading Pseudomonas // Applied and Environmental Microbiology. - 1995. - Vol. 61. - P. 357-362.
   Sukplanga P., Thongmeea A., Velaa G. Roland. Degradation of Linseed Oil Vapors by Soil Bacteria in Trickling Biofilters // Bioremediation Journal. - 1999. -Vol. 3. - P. 189-200.
   Vetrova A.A., Ovchinnikova A.A., Puntus I.F, Filonov A.E., Boronin A.M. An enhanced biodegradation of crude oil by Psedomonas plasmid-bearing strains in model soil systems // Applied Biochemistry and Microbiology. - 2010. -Vol. 46. - P. 719-725.
   Yamada К., Horiguchi S., Takahashi J. Studies on the utilization of hydrocarbons by microorganisms // Agricultural and biological chemistry. - 1965. - Vol. 29. - P. 943-948.
   Yang Y., Chen R.F., Shiaris M.P. Metabolism of naphthalene, fluorene and phenanthrene: preliminary characterization of a cloned gene cluster from Pseudomonas putida NCIB9816 // Journal of Bacteriology. - 1994. - Vol. 176. - P. 2158-2154.